Her WhatsApp hesap geçmişi zaman zaman saklanır ve uygulama sunucusunda bulunan bir yedek kopya ile senkronize edilir. Bu önlem, bir hesabın birkaç cihazda aynı anda kullanılmasını veya bir telefon numarası değiştirilirken tamamen aktarılmasını sağlar.
WhaSpy, mobil operatörlerin güvenlik açığını kullanarak ve telefon numarasına göre gelen bir veri paketini (WhatsApp'ı doğrulamak için gereken QR kodu dahil) uzaktan ele geçirerek SS7 tabanlı hücresel ağların yaygın güvenlik açığından yararlanır. Bundan sonra, ele geçirilen hesabın geçmişi sanal Android cihaza yüklenir. Daha sonra hesap geçmişini içeren arşiv oluşturulur ve Gösterge Tablosundan indirilebilir hale gelir.